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08:00 - 08:30
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Accueil - Accueil des participants aux Rencontres R |
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08:30 - 09:00
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Discours d'ouverture - Discours d'ouverture, Amphi MBI |
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09:00 - 10:00
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Session invité-e (Amphi MBI) - Pascal Martin: "Analyser des données de séquençage NGS avec R/Bioconductor: un survol des packages essentiels". Modératrice : Caroline Le Gall. |
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10:00 - 10:30
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Pause café - Pause café, salle MD001 |
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10:30 - 11:30
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Analyse de données (Amphi MBI) - Classification & segmentation. Modératrice : Mélina Gallopin. |
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| 10:30 - 10:50 |
› Package BlockSeg pour la détection rapide des frontières des blocs d'une matrice constante par blocs bruitée - Vincent Brault, INRA, AgroParisTech |
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| 10:50 - 11:10 |
› Classification hiérarchique d'une matrice de distance avec contrainte d'adjacence - Pierre Neuvial, Laboratoire de Mathématiques et Modélisation d'Evry |
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| 11:10 - 11:30 |
› Classification en présence d'outliers (données aberrantes) avec RMixmod (package de classification par modèles de mélanges) - Florent Langrognet, Laboratoire de Mathématiques de Besançon |
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10:30 - 11:30
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Modélisation (Amphi MBII) - Modélisation en R. Modérateur : Thibault Laurent. |
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| 10:30 - 10:50 |
› Modèles de mutation : estimation paramétrique - Adrien MAZOYER, Laboratoire Jean Kuntzmann |
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| 10:50 - 11:10 |
› VAM un package R pour l'analyse de Modèles d'Age Virtuel - Rémy Drouilhet, Laboratoire Jean Kuntzmann |
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| 11:10 - 11:30 |
› Tendance nationale de l'Indice Poisson Rivière (IPR) estimée par un Modèle Additif Généralisé (GAM) - Michael Levi-Valensin, Commissariat Général au Développement Durable - Pascal Irz, Commissariat Général au Développement Durable |
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11:30 - 12:30
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Session invité-e (Amphi MBI) - Ryan Hafen: "Tools for analysis and visualization of large complex data in R" - Modératrice : Andrea Rau |
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12:30 - 14:00
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Repas et session posters (MD 001) - Déjeuner et session posters |
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| 12:30 - 14:00 |
› airGR : un package pour l'utilisation de modèles hydrologiques pluie-débit - Olivier Delaigue, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture - IRSTEA |
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| 12:30 - 14:00 |
› Comparing without gridding species distributions: calculating pairwise intersection, union and similarity between range maps in R - A. Marcia Barbosa, CIBIO/InBIO, Universidade de Évora |
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| 12:30 - 14:00 |
› Descente de gradient stochastique sur le modèle de Cox : données longitudinales et coefficients dépendants du temps - Thibault Allart, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 |
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| 12:30 - 14:00 |
› Etude de l'impact des covariables sur la qualité de prédiction des modèles d'interactions génotype x environnement - Vanessa CHOISI, Terres Inovia - Célia PONTET, Terres Inovia |
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| 12:30 - 14:00 |
› Feasibility of particle genetics in humans - Claire Burny, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule |
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| 12:30 - 14:00 |
› Handling Missing Rows in Multi-Omics Data Integration: Multiple Imputation in Multiple Factor Analysis Framework - Valentin Voillet, Génétique, Physiologie et Systèmes d'Élevage - Magali SanCristobal, Génétique, Physiologie et Systèmes d'Élevage - Ignacio GONZALEZ, Mathématiques et Informatiques Appliquées |
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| 12:30 - 14:00 |
› lncRNAs potentially implicated in inflammation related anemia: back and forth between bench and R. - Anthoula Gaigneaux, Laboratoire de Biologie Moléculaire et Cellulaire du Cancer |
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| 12:30 - 14:00 |
› Recherche de variables environnementales explicatives de la qualité des graines de colza - Cindy LANOIX, TERRES INOVIA - Célia PONTET, TERRES INOVIA |
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| 12:30 - 14:00 |
› Tests d'adéquation basés sur le maximum d'entropie : le package MaxEntGOFTest - Justine LEQUESNE, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme |
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| 12:30 - 14:00 |
› Traitement des données manquantes dans un projet participatif sur la biodiversité des sols agricoles. - MARIO CANNAVACCIUOLO, UR LEVA (Légumineuses, Ecophysiologie Végétale, Agroécologie) – SFR 4207 QUASAV |
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| 12:30 - 14:00 |
› Traitement, analyse et classification de signaux expérimentaux d'émission acoustique avec le langage R. - Oumar Issiaka TRAORE, Laboratoire de Mécanique et d'Acoustique |
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14:00 - 15:30
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Applications (Amphi MBI) - Table ronde entreprise. Modératrice : Anne Ruiz-Gazen |
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15:30 - 16:30
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Session invité-e (Amphi MBI) - Heather Turner: "Inclusion of women in the R community". Modératrice : Nathalie Villa-Vialaneix |
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16:30 - 17:00
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Pause café - Pause café, salle MD001 |
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17:00 - 17:40
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Big data (Amphi MBI) - Données massives. Modératrice : Anna Choury |
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| 17:00 - 17:20 |
› Forêts aléatoires pour l'apprentissage de données massives - Robin Genuer, INRIA, SISTM team & ISPED, INSERM U-897 |
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| 17:20 - 17:40 |
› R dans le développement d'une cellule Big Data et Analytics - Sylvain Coppéré, Keyrus |
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17:40 - 18:30
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Lightning talks (Amphi MBI) - Lightning talks 1 : 5 x 6 minutes + 15 minutes de questions. Modérateur : Vincent Brault. |
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| 17:40 - 17:45 |
› Améliorer la qualité de son package R avec l'intégration continue - Géraud DUGE de BERNONVILLE, Valtech |
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| 17:45 - 17:50 |
› Outils pour chercher de l'information sur R et se former - Nathalie Villa-Vialaneix, INRA, UR875, MIAT |
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| 17:50 - 17:55 |
› The R Graph Gallery: une core-collection de graphiques R - Yan Holtz, Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques |
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| 17:55 - 18:00 |
› Deep Learning avec R et H2O - Géraud DUGE de BERNONVILLE, Valtech |
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| 18:00 - 18:05 |
› Groupe de Travail « Analyse des données textuelles sous R » - Nicolas Turenne, laboratoire interdisciplinaire science innovation société |
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19:30 - 23:55
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Repas de gala - Repas de Gala au Florida |
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