Rencontres R 2016 - Sciencesconf.org

›8:00 (30min)

Accueil

8:00 - 8:30 (30min)

Accueil

Accueil des participants aux Rencontres R

›8:30 (30min)

Discours d'ouverture

8:30 - 9:00 (30min)

Discours d'ouverture

Discours d'ouverture, Amphi MBI

›9:00 (1h)

Session invité-e
Pascal Martin: "Analyser des données de séquençage NGS avec R/Bioconductor: un survol des packages essentiels". Modératrice : Caroline Le Gall.

› Amphi MBI

9:00 - 10:00 (1h)

Session invité-e

Amphi MBI

Pascal Martin: "Analyser des données de séquençage NGS avec R/Bioconductor: un survol des packages essentiels". Modératrice : Caroline Le Gall.

›10:00 (30min)

Pause café

10:00 - 10:30 (30min)

Pause café

Pause café, salle MD001

›10:30 (1h)

Analyse de données
Classification & segmentation. Modératrice : Mélina Gallopin.

› Amphi MBI

10:30 - 11:30 (1h)

Analyse de données

Amphi MBI

Classification & segmentation. Modératrice : Mélina Gallopin.

› Package BlockSeg pour la détection rapide des frontières des blocs d'une matrice constante par blocs bruitée - Vincent Brault, INRA, AgroParisTech 10:30-10:50 (20min)

› Classification hiérarchique d'une matrice de distance avec contrainte d'adjacence - Pierre Neuvial, Laboratoire de Mathématiques et Modélisation d'Evry 10:50-11:10 (20min)

› Classification en présence d'outliers (données aberrantes) avec RMixmod (package de classification par modèles de mélanges) - Florent Langrognet, Laboratoire de Mathématiques de Besançon 11:10-11:30 (20min)

›10:30 (1h)

Modélisation
Modélisation en R. Modérateur : Thibault Laurent.

› Amphi MBII

10:30 - 11:30 (1h)

Modélisation

Amphi MBII

Modélisation en R. Modérateur : Thibault Laurent.

› Modèles de mutation : estimation paramétrique - Adrien MAZOYER, Laboratoire Jean Kuntzmann 10:30-10:50 (20min)

› VAM un package R pour l'analyse de Modèles d'Age Virtuel - Rémy Drouilhet, Laboratoire Jean Kuntzmann 10:50-11:10 (20min)

› Tendance nationale de l'Indice Poisson Rivière (IPR) estimée par un Modèle Additif Généralisé (GAM) - Michael Levi-Valensin, Commissariat Général au Développement Durable - Pascal Irz, Commissariat Général au Développement Durable 11:10-11:30 (20min)

›11:30 (1h)

Session invité-e
Ryan Hafen: "Tools for analysis and visualization of large complex data in R" - Modératrice : Andrea Rau

› Amphi MBI

11:30 - 12:30 (1h)

Session invité-e

Amphi MBI

Ryan Hafen: "Tools for analysis and visualization of large complex data in R" - Modératrice : Andrea Rau

›12:30 (1h30)

Repas et session posters
Déjeuner et session posters

› MD 001

12:30 - 14:00 (1h30)

Repas et session posters

MD 001

Déjeuner et session posters

› airGR : un package pour l'utilisation de modèles hydrologiques pluie-débit - Olivier Delaigue, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture - IRSTEA 12:30-14:00 (1h30)

› Comparing without gridding species distributions: calculating pairwise intersection, union and similarity between range maps in R - A. Marcia Barbosa, CIBIO/InBIO, Universidade de Évora 12:30-14:00 (1h30)

› Descente de gradient stochastique sur le modèle de Cox : données longitudinales et coefficients dépendants du temps - Thibault Allart, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 12:30-14:00 (1h30)

› Etude de l'impact des covariables sur la qualité de prédiction des modèles d'interactions génotype x environnement - Vanessa CHOISI, Terres Inovia - Célia PONTET, Terres Inovia 12:30-14:00 (1h30)

› Feasibility of particle genetics in humans - Claire Burny, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule 12:30-14:00 (1h30)

› Handling Missing Rows in Multi-Omics Data Integration: Multiple Imputation in Multiple Factor Analysis Framework - Valentin Voillet, Génétique, Physiologie et Systèmes d'Élevage - Magali SanCristobal, Génétique, Physiologie et Systèmes d'Élevage - Ignacio GONZALEZ, Mathématiques et Informatiques Appliquées 12:30-14:00 (1h30)

› lncRNAs potentially implicated in inflammation related anemia: back and forth between bench and R. - Anthoula Gaigneaux, Laboratoire de Biologie Moléculaire et Cellulaire du Cancer 12:30-14:00 (1h30)

› Recherche de variables environnementales explicatives de la qualité des graines de colza - Cindy LANOIX, TERRES INOVIA - Célia PONTET, TERRES INOVIA 12:30-14:00 (1h30)

› Tests d'adéquation basés sur le maximum d'entropie : le package MaxEntGOFTest - Justine LEQUESNE, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme 12:30-14:00 (1h30)

› Traitement des données manquantes dans un projet participatif sur la biodiversité des sols agricoles. - MARIO CANNAVACCIUOLO, UR LEVA (Légumineuses, Ecophysiologie Végétale, Agroécologie) – SFR 4207 QUASAV 12:30-14:00 (1h30)

› Traitement, analyse et classification de signaux expérimentaux d'émission acoustique avec le langage R. - Oumar Issiaka TRAORE, Laboratoire de Mécanique et d'Acoustique 12:30-14:00 (1h30)

›14:00 (1h30)

Applications
Table ronde entreprise. Modératrice : Anne Ruiz-Gazen

› Amphi MBI

14:00 - 15:30 (1h30)

Applications

Amphi MBI

Table ronde entreprise. Modératrice : Anne Ruiz-Gazen

›15:30 (1h)

Session invité-e
Heather Turner: "Inclusion of women in the R community". Modératrice : Nathalie Villa-Vialaneix

› Amphi MBI

15:30 - 16:30 (1h)

Session invité-e

Amphi MBI

Heather Turner: "Inclusion of women in the R community". Modératrice : Nathalie Villa-Vialaneix

›16:30 (30min)

Pause café

16:30 - 17:00 (30min)

Pause café

Pause café, salle MD001

›17:00 (40min)

Big data
Données massives. Modératrice : Anna Choury

› Amphi MBI

17:00 - 17:40 (40min)

Big data

Amphi MBI

Données massives. Modératrice : Anna Choury

› Forêts aléatoires pour l'apprentissage de données massives - Robin Genuer, INRIA, SISTM team & ISPED, INSERM U-897 17:00-17:20 (20min)

› R dans le développement d'une cellule Big Data et Analytics - Sylvain Coppéré, Keyrus 17:20-17:40 (20min)

›17:40 (50min)

Lightning talks
Lightning talks 1 : 5 x 6 minutes + 15 minutes de questions. Modérateur : Vincent Brault.

› Amphi MBI

17:40 - 18:30 (50min)

Lightning talks

Amphi MBI

Lightning talks 1 : 5 x 6 minutes + 15 minutes de questions. Modérateur : Vincent Brault.

› Améliorer la qualité de son package R avec l'intégration continue - Géraud DUGE de BERNONVILLE, Valtech 17:40-17:45 (05min)

› Outils pour chercher de l'information sur R et se former - Nathalie Villa-Vialaneix, INRA, UR875, MIAT 17:45-17:50 (05min)

› The R Graph Gallery: une core-collection de graphiques R - Yan Holtz, Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques 17:50-17:55 (05min)

› Deep Learning avec R et H2O - Géraud DUGE de BERNONVILLE, Valtech 17:55-18:00 (05min)

› Groupe de Travail « Analyse des données textuelles sous R » - Nicolas Turenne, laboratoire interdisciplinaire science innovation société 18:00-18:05 (05min)

›19:30 (4h25)

Repas de gala

19:30 - 23:55 (4h25)

Repas de gala

Repas de Gala au Florida