Programme détaillé

Semaine Mer. 22 Jeu. 23 Ven. 24 Liste

	Mer. 22	Jeu. 23	Ven. 24
08:00 09:00 10:00 11:00 12:00 13:00 14:00 15:00 16:00 17:00 18:00 19:00 20:00 21:00 22:00 23:00	Accueil des participants 13:00 - 14:00 (1h) Accueil des participants Accueil des participants, entrée de la manufacture des tabacs Tutoriel Tutoriel 14:00 - 17:00 (3h) Tutoriel MQ 003 Tutoriel Cartographie avec R 14:00 - 17:00 (3h) Tutoriel MQ 210 Tutoriel R2D2 Pot d'accueil 17:00 - 18:00 (1h) Pot d'accueil Pot d'accueil, salle MD001	Accueil 8:00 - 8:30 (30min) Accueil Accueil des participants aux Rencontres R Discours d'ouverture 8:30 - 9:00 (30min) Discours d'ouverture Discours d'ouverture, Amphi MBI Session invité-e 9:00 - 10:00 (1h) Session invité-e Amphi MBI Pascal Martin: "Analyser des données de séquençage NGS avec R/Bioconductor: un survol des packages essentiels". Modératrice : Caroline Le Gall. Pause café 10:00 - 10:30 (30min) Pause café Pause café, salle MD001 Analyse de données Modélisation 10:30 - 11:30 (1h) Analyse de données Amphi MBI Classification & segmentation. Modératrice : Mélina Gallopin. › Package BlockSeg pour la détection rapide des frontières des blocs d'une matrice constante par blocs bruitée - Vincent Brault, INRA, AgroParisTech 10:30-10:50 (20min) › Classification hiérarchique d'une matrice de distance avec contrainte d'adjacence - Pierre Neuvial, Laboratoire de Mathématiques et Modélisation d'Evry 10:50-11:10 (20min) › Classification en présence d'outliers (données aberrantes) avec RMixmod (package de classification par modèles de mélanges) - Florent Langrognet, Laboratoire de Mathématiques de Besançon 11:10-11:30 (20min) 10:30 - 11:30 (1h) Modélisation Amphi MBII Modélisation en R. Modérateur : Thibault Laurent. › Modèles de mutation : estimation paramétrique - Adrien MAZOYER, Laboratoire Jean Kuntzmann 10:30-10:50 (20min) › VAM un package R pour l'analyse de Modèles d'Age Virtuel - Rémy Drouilhet, Laboratoire Jean Kuntzmann 10:50-11:10 (20min) › Tendance nationale de l'Indice Poisson Rivière (IPR) estimée par un Modèle Additif Généralisé (GAM) - Michael Levi-Valensin, Commissariat Général au Développement Durable - Pascal Irz, Commissariat Général au Développement Durable 11:10-11:30 (20min) Session invité-e 11:30 - 12:30 (1h) Session invité-e Amphi MBI Ryan Hafen: "Tools for analysis and visualization of large complex data in R" - Modératrice : Andrea Rau Repas et session posters 12:30 - 14:00 (1h30) Repas et session posters MD 001 Déjeuner et session posters › airGR : un package pour l'utilisation de modèles hydrologiques pluie-débit - Olivier Delaigue, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture - IRSTEA 12:30-14:00 (1h30) › Comparing without gridding species distributions: calculating pairwise intersection, union and similarity between range maps in R - A. Marcia Barbosa, CIBIO/InBIO, Universidade de Évora 12:30-14:00 (1h30) › Descente de gradient stochastique sur le modèle de Cox : données longitudinales et coefficients dépendants du temps - Thibault Allart, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 12:30-14:00 (1h30) › Etude de l'impact des covariables sur la qualité de prédiction des modèles d'interactions génotype x environnement - Vanessa CHOISI, Terres Inovia - Célia PONTET, Terres Inovia 12:30-14:00 (1h30) › Feasibility of particle genetics in humans - Claire Burny, Laboratoire de Biologie et Modélisation de la Cellule 12:30-14:00 (1h30) › Handling Missing Rows in Multi-Omics Data Integration: Multiple Imputation in Multiple Factor Analysis Framework - Valentin Voillet, Génétique, Physiologie et Systèmes d'Élevage - Magali SanCristobal, Génétique, Physiologie et Systèmes d'Élevage - Ignacio GONZALEZ, Mathématiques et Informatiques Appliquées 12:30-14:00 (1h30) › lncRNAs potentially implicated in inflammation related anemia: back and forth between bench and R. - Anthoula Gaigneaux, Laboratoire de Biologie Moléculaire et Cellulaire du Cancer 12:30-14:00 (1h30) › Recherche de variables environnementales explicatives de la qualité des graines de colza - Cindy LANOIX, TERRES INOVIA - Célia PONTET, TERRES INOVIA 12:30-14:00 (1h30) › Tests d'adéquation basés sur le maximum d'entropie : le package MaxEntGOFTest - Justine LEQUESNE, Laboratoire de Mathématiques Nicolas Oresme 12:30-14:00 (1h30) › Traitement des données manquantes dans un projet participatif sur la biodiversité des sols agricoles. - MARIO CANNAVACCIUOLO, UR LEVA (Légumineuses, Ecophysiologie Végétale, Agroécologie) – SFR 4207 QUASAV 12:30-14:00 (1h30) › Traitement, analyse et classification de signaux expérimentaux d'émission acoustique avec le langage R. - Oumar Issiaka TRAORE, Laboratoire de Mécanique et d'Acoustique 12:30-14:00 (1h30) Applications 14:00 - 15:30 (1h30) Applications Amphi MBI Table ronde entreprise. Modératrice : Anne Ruiz-Gazen Session invité-e 15:30 - 16:30 (1h) Session invité-e Amphi MBI Heather Turner: "Inclusion of women in the R community". Modératrice : Nathalie Villa-Vialaneix Pause café 16:30 - 17:00 (30min) Pause café Pause café, salle MD001 Big data 17:00 - 17:40 (40min) Big data Amphi MBI Données massives. Modératrice : Anna Choury › Forêts aléatoires pour l'apprentissage de données massives - Robin Genuer, INRIA, SISTM team & ISPED, INSERM U-897 17:00-17:20 (20min) › R dans le développement d'une cellule Big Data et Analytics - Sylvain Coppéré, Keyrus 17:20-17:40 (20min) Lightning talks 17:40 - 18:30 (50min) Lightning talks Amphi MBI Lightning talks 1 : 5 x 6 minutes + 15 minutes de questions. Modérateur : Vincent Brault. › Améliorer la qualité de son package R avec l'intégration continue - Géraud DUGE de BERNONVILLE, Valtech 17:40-17:45 (05min) › Outils pour chercher de l'information sur R et se former - Nathalie Villa-Vialaneix, INRA, UR875, MIAT 17:45-17:50 (05min) › The R Graph Gallery: une core-collection de graphiques R - Yan Holtz, Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques 17:50-17:55 (05min) › Deep Learning avec R et H2O - Géraud DUGE de BERNONVILLE, Valtech 17:55-18:00 (05min) › Groupe de Travail « Analyse des données textuelles sous R » - Nicolas Turenne, laboratoire interdisciplinaire science innovation société 18:00-18:05 (05min) Repas de gala 19:30 - 23:55 (4h25) Repas de gala Repas de Gala au Florida	Visualisation Analyse de données 9:00 - 10:00 (1h) Visualisation Amphi MBI Visualisation et interactivité Shiny. Modérateur : Stéphane Dray › Présentation du package rAmCharts - Jeffery Petit, Datastorm 09:00-09:20 (20min) › Observatoire des prix des carburants : Visualisation Shiny app - Ignacio INOA, Microeconomix 09:20-09:40 (20min) › R++, the Next Step - Christophe Genolini, Inserm U1027 09:40-10:00 (20min) 9:00 - 10:00 (1h) Analyse de données Amphi MBII Analyse de données en industrie. Modérateur : Éric Matzner-Lober. › Etude de cas avec le package R rvest - Amélie NEVEUX, Groupe AVISIA 09:00-09:20 (20min) › Analyse de parcours client en mode multicanal - Romain ANNE, Wide agency (Micropole Group) - Chrystel GALISSIE, Wide agency (Micropole Group) - Frédéric BOMY, Wide agency (Micropole Group) - Patrice MICHEL, Wide agency (Micropole Group) 09:20-09:40 (20min) › Utilisation du carroyage INSEE combiné avec les communes - Anne GAYET, A.I.D. 09:40-10:00 (20min) Pause café 10:00 - 10:30 (30min) Pause café Pause café, salle MD001 Session invité-e 10:30 - 11:30 (1h) Session invité-e Amphi MBI François Husson: "De la simple vignette à l'enseignement par les MOOC, quelques idées pour améliorer la visibilité et l'accessibilité de son package R". Modérateur : Sébastien Déjean. Applications Modélisation 11:30 - 12:30 (1h) Applications Amphi MBI Applications omiques. Modératrice : Sandrine Laguerre. › Group and Sparse Group Partial Least Square Approaches Applied in Genomics Context - Benoit Liquet, Université de Pau et Pays de L'Adour 11:30-11:50 (20min) › mixMint: A multivariate integrative approach to identify a reproducible biomarker signature across multiple experiments and platforms - Florian Rohart, The University of Queensland Diamantina Institute 11:50-12:10 (20min) 11:30 - 12:30 (1h) Modélisation Amphi MBII Modélisation & analyse de données. Modératrice : Marie Chavent. › mbbefd: modélisation des taux de destruction en actuariat non vie - Christophe Dutang, Laboratoire Manceau de Mathématiques 11:30-11:50 (20min) › extremefit : un package pour estimer les probabilités et quantiles conditionnels extrêmes - Kévin Jaunâtre, Laboratoire de Mathématiques de Bretagne Atlantique 11:50-12:10 (20min) Repas et session posters 12:30 - 14:00 (1h30) Repas et session posters MD 001 Session invité-e 14:00 - 15:00 (1h) Session invité-e Amphi MBI Anne-Laure Boulesteix: "IPF-LASSO: integrative L1-penalized regression with penalty factors for prediction based on multi-omics data". Modérateur : Pierre Neuvial. Lightning talks 15:00 - 15:45 (45min) Lightning talks Amphi MBI Lightning talk 2 : 5 x 6 minutes + 15 minutes de questions. Modérateur : Xavier Gendre. › La méthode shock : réduction de dimension en inférence de réseaux - Mélina Gallopin, Université Paris Descartes 15:00-15:05 (05min) › MixAll: Un logiciel de classification non-supervisée - Serge Iovleff, UMR 8524 15:05-15:10 (05min) › tess3r : un package R pour l'estimation de la structure génétique des populations spatialisées - kevin caye, Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble 15:10-15:15 (05min) › Outils pour l'analyse et la simulation de données RNA-seq - Alyssa Imbert, INRA, UR875, MIAT 15:15-15:20 (05min) › BRCAnegApp : une application web Shiny pour aider les oncogénéticiens à classer les familles BRCA1/2 négatives selon leur risque de cancer du sein. - Youenn Drouet, Equipe Biostatistiques Santé - UMR CNRS 5558 Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, Unité de Prévention et d'Epidémiologie Génétique - Centre Léon Bérard 15:20-15:25 (05min) Clôture et dernière pause café 15:45 - 16:15 (30min) Clôture et dernière pause café Clôture des 5èmes Rencontres R suivi d'un café salle MD001

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